Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD2P0DJD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms