Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms