Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC175P0C221 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms