Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms