Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TNP1P09430 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TNP1P09430 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TNP1P09430 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms