Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIL1P09327 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIL1P09327 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIL1P09327 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIL1P09327 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIL1P09327 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIL1P09327 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VIL1P09327 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIL1P09327 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIL1P09327 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIL1P09327 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIL1P09327 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIL1P09327 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIL1P09327 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VIL1P09327 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIL1P09327 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIL1P09327 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VIL1P09327 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIL1P09327 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIL1P09327 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms