Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP10P09238 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP10P09238 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP10P09238 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP10P09238 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP10P09238 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP10P09238 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP10P09238 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP10P09238 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP10P09238 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP10P09238 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP10P09238 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP10P09238 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP10P09238 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP10P09238 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP10P09238 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP10P09238 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP10P09238 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP10P09238 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP10P09238 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP10P09238 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP10P09238 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP10P09238 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP10P09238 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP10P09238 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP10P09238 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP10P09238 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP10P09238 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP10P09238 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms