Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF1RP07333 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF1RP07333 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms