Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3P05106 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms