Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOA1P02647 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOA1P02647 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOA1P02647 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOA1P02647 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOA1P02647 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOA1P02647 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOA1P02647 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms