Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA3O96018 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA3O96018 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA3O96018 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA3O96018 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA3O96018 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA3O96018 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA3O96018 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA3O96018 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA3O96018 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA3O96018 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA3O96018 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA3O96018 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA3O96018 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBA3O96018 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBA3O96018 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA3O96018 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA3O96018 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA3O96018 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA3O96018 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA3O96018 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA3O96018 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA3O96018 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBA3O96018 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA3O96018 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA3O96018 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA3O96018 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA3O96018 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA3O96018 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA3O96018 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA3O96018 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA3O96018 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBA3O96018 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APBA3O96018 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APBA3O96018 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
APBA3O96018 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APBA3O96018 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APBA3O96018 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA3O96018 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA3O96018 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA3O96018 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA3O96018 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA3O96018 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA3O96018 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA3O96018 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA3O96018 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APBA3O96018 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APBA3O96018 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APBA3O96018 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA3O96018 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA3O96018 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA3O96018 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA3O96018 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA3O96018 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA3O96018 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA3O96018 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APBA3O96018 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA3O96018 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA3O96018 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA3O96018 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA3O96018 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA3O96018 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA3O96018 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms