Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX6O95947 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX6O95947 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX6O95947 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX6O95947 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX6O95947 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX6O95947 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX6O95947 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX6O95947 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX6O95947 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX6O95947 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX6O95947 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX6O95947 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX6O95947 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX6O95947 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms