Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4FO95754 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4FO95754 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4FO95754 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4FO95754 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4FO95754 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4FO95754 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4FO95754 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4FO95754 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4FO95754 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4FO95754 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4FO95754 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4FO95754 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4FO95754 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms