Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL3O95573 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms