Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF1O95521 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF1O95521 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF1O95521 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF1O95521 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF1O95521 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF1O95521 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF1O95521 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms