Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPBO95292 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPBO95292 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPBO95292 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPBO95292 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAPBO95292 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms