Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN1O94985 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms