Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN15O75808 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN15O75808 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms