Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX3O75364 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX3O75364 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX3O75364 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX3O75364 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms