Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSCO60682 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MSCO60682 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MSCO60682 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MSCO60682 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSCO60682 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSCO60682 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSCO60682 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSCO60682 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSCO60682 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSCO60682 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSCO60682 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSCO60682 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSCO60682 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSCO60682 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSCO60682 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSCO60682 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSCO60682 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSCO60682 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSCO60682 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSCO60682 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSCO60682 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSCO60682 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSCO60682 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms