Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR5O60602 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR5O60602 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR5O60602 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR5O60602 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR5O60602 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR5O60602 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR5O60602 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR5O60602 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR5O60602 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR5O60602 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms