Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LANCL1O43813 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms