Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSNA1O43805 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSNA1O43805 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSNA1O43805 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSNA1O43805 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSNA1O43805 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSNA1O43805 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms