Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms