Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB2O43741 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms