Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMM44O43615 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms