Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DENRO43583 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DENRO43583 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DENRO43583 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DENRO43583 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DENRO43583 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DENRO43583 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DENRO43583 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DENRO43583 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms