Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COCHO43405 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COCHO43405 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COCHO43405 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COCHO43405 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COCHO43405 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms