Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN4O15554 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms