Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms