Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNPHO15079 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNPHO15079 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNPHO15079 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNPHO15079 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNPHO15079 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNPHO15079 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNPHO15079 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNPHO15079 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNPHO15079 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNPHO15079 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNPHO15079 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNPHO15079 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNPHO15079 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNPHO15079 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNPHO15079 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNPHO15079 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNPHO15079 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNPHO15079 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNPHO15079 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNPHO15079 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNPHO15079 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNPHO15079 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms