Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms