Protein–RNA interactions for Protein: O14994

SYN3, Synapsin-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3O14994 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN3O14994 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN3O14994 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN3O14994 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN3O14994 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN3O14994 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN3O14994 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN3O14994 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN3O14994 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN3O14994 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN3O14994 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN3O14994 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN3O14994 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN3O14994 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN3O14994 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN3O14994 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN3O14994 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN3O14994 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN3O14994 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN3O14994 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN3O14994 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN3O14994 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN3O14994 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN3O14994 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN3O14994 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN3O14994 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN3O14994 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN3O14994 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN3O14994 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN3O14994 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN3O14994 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN3O14994 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN3O14994 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN3O14994 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms