Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN9O14815 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN9O14815 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms