Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms