Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPSO00116 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPSO00116 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPSO00116 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPSO00116 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPSO00116 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPSO00116 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPSO00116 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGPSO00116 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPSO00116 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGPSO00116 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPSO00116 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPSO00116 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPSO00116 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPSO00116 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPSO00116 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPSO00116 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGPSO00116 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPSO00116 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPSO00116 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPSO00116 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPSO00116 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPSO00116 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPSO00116 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPSO00116 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPSO00116 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPSO00116 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPSO00116 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPSO00116 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPSO00116 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPSO00116 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPSO00116 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms