Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMKR1H3BMG3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms