Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms