Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK3BL2E5RIL1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms