Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS37CA5D8V6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms