Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRAMEF27A3QJZ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms