Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms