Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLRN2A0PK11 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLRN2A0PK11 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLRN2A0PK11 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLRN2A0PK11 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLRN2A0PK11 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLRN2A0PK11 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLRN2A0PK11 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
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