Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 KATNBL1-206ENST00000559462 562 ntTSL 216.21■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 AP2A2-208ENST00000526401 631 ntTSL 216.15■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SECISBP2L-208ENST00000559424 1084 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 PPP4R1-206ENST00000577779 481 ntTSL 215.77■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 TMEM14C-203ENST00000467415 899 ntTSL 315.63■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CNTROB-212ENST00000576538 784 ntTSL 515.6■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CEP57L1-218ENST00000522461 575 ntTSL 415.58■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 KATNBL1-214ENST00000560671 924 ntTSL 215.56■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 LIG1-208ENST00000595758 606 ntTSL 415.56■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ZNF276-205ENST00000563541 588 ntTSL 315.44■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CASP2-202ENST00000350623 1146 ntTSL 1 (best)15.42■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CEP57L1-206ENST00000518329 812 ntTSL 215.42■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.045e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 AMOTL1-204ENST00000537191 857 ntTSL 215.28■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 EIF5-203ENST00000558265 872 ntTSL 515.28■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 AUP1-205ENST00000464887 845 ntTSL 215.26■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CEP57L1-217ENST00000521737 559 ntTSL 515.23■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 NUPL2-203ENST00000413919 1329 ntTSL 315.19■□□□□ 0.024e-10■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 LDAH-205ENST00000412261 566 ntTSL 415.09■□□□□ 0.015e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 NCSTN-203ENST00000421914 776 ntTSL 415.07■□□□□ 04e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -04e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ABHD5-204ENST00000456453 876 ntTSL 414.99□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 EIF5-216ENST00000560877 521 ntTSL 414.96□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 MAN2A2-212ENST00000559341 623 ntTSL 214.85□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 RAD23A-206ENST00000590881 999 ntTSL 514.84□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.034e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SPG7-206ENST00000562775 1595 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 TANK-223ENST00000494976 636 ntTSL 314.8□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 KATNBL1-203ENST00000557877 797 ntTSL 514.8□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 UBE2T-203ENST00000487227 885 ntTSL 314.78□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 APTX-221ENST00000477119 568 ntTSL 314.76□□□□□ -0.055e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 PSMB4-207ENST00000495805 811 ntTSL 214.7□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 HEXDC-205ENST00000578616 862 ntTSL 314.65□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 EIF5-204ENST00000558316 719 ntTSL 314.59□□□□□ -0.074e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 DUS1L-210ENST00000578846 4456 ntTSL 214.59□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 APTX-202ENST00000379812 599 ntTSL 514.52□□□□□ -0.085e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 APTX-231ENST00000494973 547 ntTSL 414.52□□□□□ -0.085e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 MAN2A2-203ENST00000557990 956 ntTSL 514.43□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SECISBP2L-202ENST00000380927 2551 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 PTPA-224ENST00000453358 548 ntTSL 414.36□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 LIG1-212ENST00000596549 580 ntTSL 414.34□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 PDIA6-206ENST00000489662 564 ntTSL 414.32□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.124e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CEP57L1-220ENST00000522608 769 ntTSL 514.26□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 NFE2L1-213ENST00000581441 552 ntTSL 414.16□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 514.15□□□□□ -0.144e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 214.13□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CEP57L1-210ENST00000519407 598 ntTSL 314.09□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CEP57L1-215ENST00000521503 446 ntTSL 414.09□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 GRK6-209ENST00000512684 336 ntTSL 314.02□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CEP57L1-224ENST00000524064 819 ntTSL 513.96□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.195e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ZNF276-211ENST00000569582 436 ntTSL 213.87□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 NFE2L1-209ENST00000579889 568 ntTSL 313.84□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 NUPL2-204ENST00000437140 1285 ntTSL 513.76□□□□□ -0.214e-10■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ARHGAP19-204ENST00000466484 601 ntTSL 313.61□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.255e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.255e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 STAT5A-206ENST00000479417 553 ntTSL 313.49□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ILK-211ENST00000530016 1696 ntTSL 213.48□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.255e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ATXN2L-209ENST00000562686 489 ntTSL 313.44□□□□□ -0.264e-8■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.274e-10■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 LIG1-217ENST00000599165 570 ntTSL 413.3□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 NUPL2-205ENST00000438012 1653 ntTSL 213.18□□□□□ -0.34e-10■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ILK-208ENST00000527121 891 ntTSL 513.17□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 CNTROB-205ENST00000570784 695 ntTSL 313.13□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ORMDL3-203ENST00000579287 349 ntTSL 313.11□□□□□ -0.315e-11■■■■■ 34.5
SF3B1O75533 ZNF276-207ENST00000564004 2845 ntTSL 213.1□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 34.5
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 3388.3 ms