Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 VIL1-202ENST00000392114 1968 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 PTPRR-209ENST00000549308 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 LAMA4-201ENST00000230538 6547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 CLDN10-203ENST00000376873 2656 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 NCOA4-203ENST00000580070 1755 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 REG1B-201ENST00000305089 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 MAPT-202ENST00000334239 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AC111200.1-201ENST00000358778 657 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AL031663.2-201ENST00000417630 355 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AGAP13P-201ENST00000417888 363 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 HSD3BP2-201ENST00000457615 1118 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 RPL34-207ENST00000506397 549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P04436 TCF4-AS1-201ENST00000587660 396 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AC072062.1-201ENST00000617699 351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AC026401.3-201ENST00000624682 882 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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P04436 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 CIITA-212ENST00000618207 2844 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AP003559.1-201ENST00000540906 1831 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 FAM133B-203ENST00000438306 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 DHDDS-201ENST00000236342 1403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P04436 CDK14-202ENST00000380050 4995 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P04436 ADAMTSL3-205ENST00000567476 6873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P04436 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04436 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P04436 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P04436 INVS-202ENST00000262457 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 LINC01480-204ENST00000597199 1718 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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P04436 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 TP53TG3F-201ENST00000617705 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P04436 NOXRED1-201ENST00000380835 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 ZSWIM5P2-201ENST00000420212 2038 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 GTF2H2-202ENST00000330280 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 OR6F1-201ENST00000302084 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 MYLPF-201ENST00000322861 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 SPTLC1-202ENST00000337841 946 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 PTRH2-201ENST00000393038 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 AC245517.1-201ENST00000444224 1262 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04436 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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