Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQE9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQE9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQE9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQE9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U3KQE9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
U3KQE9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U3KQE9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms