Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A3GALT2U3KPV4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A3GALT2U3KPV4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A3GALT2U3KPV4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A3GALT2U3KPV4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A3GALT2U3KPV4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A3GALT2U3KPV4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A3GALT2U3KPV4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A3GALT2U3KPV4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A3GALT2U3KPV4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A3GALT2U3KPV4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms