Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA1Q9Y6Y1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms