Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms