Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C3Q9Y5Q9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms